BioInformaticsGRX (RSG Spain Granada Node) presenta, como inicio de temporada, un BioInfoClub titulado "Inferencia de Actividad de Factores de Transcripción en Lupus Eritematoso Sistémico".

El Lupus Eritematoso Sistémico es una enfermedad autoinmune que presenta una gran y heterogénea cantidad de manifestaciones clínicas. Los factores de transcripción son proteínas que se unen a regiones específicas para regular la transcripción de uno o varios genes determinados. Nuestro interés es conocer los factores de transcripción que están actuando en la enfermedad. Para ello vamos a inferir la actividad de estos factores de transcripción en base a datos transcriptómicos de los genes que regulan y comprobar que factores de transcripción tienen una actividad diferente entre las muestras de lupus y muestras sanas. Además, debido a su heterogeneidad, hemos tenido que llevar a cabo técnicas de clustering para identificar diferentes subgrupos de la enfermedad y hacer análisis específicos de cada uno de ellos.

Articulo: https://doi.org/10.3390/life11040299

Lopez-Dominguez R, Toro-Dominguez D, Martorell-Marugan J, Garcia-Moreno A, Holland CH, Saez-Rodriguez J, Goldman D, Petri MA, Alarcon-Riquelme ME, Carmona-Saez P. Transcription Factor Activity Inference in Systemic Lupus Erythematosus. Life (Basel). 2021 Apr 1;11(4):299. doi: 10.3390/life11040299. PMID: 33915751; PMCID: PMC8065841.

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